阜阳市第二人民医院始建于1972年，前身为阜阳行署传染病医院，1997年在全国专科医院中首家按照综合医院标准通过二级甲等综合医院评审，2011年初在全省首家通过三级甲等传染病专科医院评审，正式成为以“强专科、大综合”为特色的三级甲等医院，安徽医科大学阜阳临床学院和研究生班教学点，蚌埠医学院教学医院，多项诊疗技术居阜阳市领先水平，是皖西北地区医疗、预防、教学、研究中心之一，医疗服务范围辐射周边省、市地区。年门急诊总量达45万人次，住院病人达三万人次。
　　全院占地面积6. 07万平方米，是阜城占地规模最大的医院，拥有固定资产2.6亿元，在职职工1100余人，其中高中级专业技术人员650人，编制床位1000张，实际开放床位1200张。传染病部分设有感染一科、感染二科、感染病ICU、应急病区、结核病科、肝病一科、肝病二科、肝病三科；内科部分设有呼吸内科、肾病科、血液透析中心、心血管内科、神经内科、内分泌血液科、消化内科、肿瘤内科、干部（特需）病房；外科部分设有普外科、胸心外科、神经外科、泌尿外科、血管外科、骨一科、骨二科、妇科、产科、男科、皮肤科；其它临床学科设有儿科、急诊科、重症